세션 관련되어 점검해야할 범위가 많아 작성하여 주신 정보만으로 원인이나 문제 해결 방법을 알려드리기 힘들것 같습니다.

redis에 이상이 있지 않다면 설정된 세션 만료시간에 따라 세션이 삭제되는게 맞습니다.

redis는 완벽한 물건이 아닙니다.

이는 ci 문제나 php 만의 문제가 아닙니다.

redis를 세션으로 사용한다면 신뢰성을 위해 백업이 하나 필요합니다.

redis를 먼저 체크하고, 값이 정상이  아닌경우 db 세션을 한번더 체크 하는 식으로 합니다.

저는 predis 설치해서 세션 물려 놓았더니 로그에 간간히 redis 커넥션 페일이 로그에 간간히 나타나더군요.

redis가 문제가 있다면 file 이나 db 로 테스트해보고 어디가 문제인지 소프트웨어의 무결성을 증명 하셔야합니다.